118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2123 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  36.84 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  34.47 
 
 
236 aa  92  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  31.53 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  29.56 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  33.62 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  37.99 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  29.82 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  29.56 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  37.41 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  34.16 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  29.06 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  34.62 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  34.62 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  33.53 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  35.08 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  34.15 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  34.67 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  32.78 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  32.78 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  32.78 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  32.78 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  32.78 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  32.78 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  34.97 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  35.05 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  30.48 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  32.7 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  33.52 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  33.67 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  34.12 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  30.21 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.15 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  33.76 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.15 
 
 
459 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.15 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.15 
 
 
459 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.88 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.23 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  27.88 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.12 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.61 
 
 
466 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  31.4 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.06 
 
 
458 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1192  nucleoside phosphorylase  24.5 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.69 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.01 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.88 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.44 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.37 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.46 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.17 
 
 
657 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  32.88 
 
 
497 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.79 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  29.31 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  23.93 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0497  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.04 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.36672 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2076  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.76 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.806649  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  24.16 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.16 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.74 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0855  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.73 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.3 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.12 
 
 
233 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.9 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1115  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.3 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1001  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.1 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  29.7 
 
 
246 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  28.37 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  23.56 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1217  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.56 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  45 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  25.11 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.07 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2130  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.21 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.343593  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0528  MTA/SAH nucleosidase  31.34 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0176375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  25 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.23 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1176  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.02 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.633739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.02 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  32.97 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.02 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.603402 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3443  Adenosylhomocysteine nucleosidase  43.59 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  26.56 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.02 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0151  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  43.59 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>