74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2078 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  33.62 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  33.62 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  29.18 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  33.48 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  34.46 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  33.53 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  34.68 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  32.62 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  30.34 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  31.61 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  32.57 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  32.57 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  29.8 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  29.54 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  33.56 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  29.05 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  32.03 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  32.03 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  32.03 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  31.94 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  31.94 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  32.03 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  33.53 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  32.03 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  31.94 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  30.49 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  31.31 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  31.37 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  38.36 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  32.18 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  32.12 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  31.95 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  29.17 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.49 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  31.95 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  32.77 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  28.93 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  38.98 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.66 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  28.93 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  33.56 
 
 		 657 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  25.91 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  28.14 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  35.06 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  28.39 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  28.93 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.09 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.09 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0606  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.87 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  29.19 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.33 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0361  purine or other phosphorylase family 1  30.54 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.75 
 
 		 458 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I07  MTA/SAH nucleosidase  23.35 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.179437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.57 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  33.03 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0384  Adenosylhomocysteine nucleosidase  40.98 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.799751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.05 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  25 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.86 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.74 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 		 459 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.23 
 
 		 459 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.85 
 
 		 232 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  32 
 
 		 246 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  30.86 
 
 		 230 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>