92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0811 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  100 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  44.39 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  34.89 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  34.89 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  38.22 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  33.48 
 
 
258 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  34.39 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  34.76 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  31.65 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  32.26 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  35.8 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  34.76 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  34.15 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  31.94 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  34.5 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  32.93 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  34.64 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  28.4 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  36.89 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  35.29 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  29.8 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  35.5 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  36.02 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  35.5 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  35.5 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  35.14 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  34.27 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  35.12 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  34.27 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  33.87 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  30.29 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0361  purine or other phosphorylase family 1  31.58 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  31.73 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  33.71 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  33.71 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  33.71 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  28.03 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  32.97 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  33.94 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  34.27 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  30.27 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  30.72 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  32.96 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  31.22 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.5 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.13 
 
 
466 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0302  purine phosphorylases family protein 1  28.76 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0124771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.13 
 
 
458 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  34.08 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.81 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  30.77 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0220  MTA/SAH nucleosidase  28.18 
 
 
236 aa  52  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  35.66 
 
 
497 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  34.81 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1054  Adenosylhomocysteine nucleosidase  29.8 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  26.9 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  28 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.54 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.25 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.62 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.62 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.62 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.62 
 
 
459 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.62 
 
 
459 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  29.22 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  23.36 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.12 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.62 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.24 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  27.78 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.56 
 
 
657 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.88 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1392  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.59 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.285892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.68 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.38 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0384  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.36 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.799751  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.97 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.33 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.33 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  26.99 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  24.44 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.71 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  29.11 
 
 
253 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.57 
 
 
222 aa  42  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>