23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1662 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  48.03 
 
 
250 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  45.85 
 
 
230 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4823  purine or other phosphorylase family 1  44.3 
 
 
248 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00149487  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  37.33 
 
 
244 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  37.5 
 
 
244 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  29.27 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  28.4 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  22.73 
 
 
286 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  27.1 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  25.41 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  23.93 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.37 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  26.03 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  28.8 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  26.09 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  24.36 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  24.67 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  26.56 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  24.67 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  23.63 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  25.3 
 
 
255 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>