91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1319 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  100 
 
 
235 aa  460  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  44.39 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  39.41 
 
 
246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  37.73 
 
 
218 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  36.84 
 
 
237 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  36.84 
 
 
237 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  38.71 
 
 
221 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  38.8 
 
 
235 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  40.46 
 
 
242 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  38.57 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  38.25 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  34.93 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  34.94 
 
 
235 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  37.28 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  37.28 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  37.28 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  37.28 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  37.28 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  37.28 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  37.28 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  36.26 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  37.06 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  36.07 
 
 
234 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  37.06 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  44.94 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  36.46 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  35 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  32.58 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  31.46 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  33.67 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  29.65 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  32.62 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  33.15 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  30.39 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  32.46 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  29.65 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  31.43 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  32.56 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  31.4 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  30.15 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  29.95 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  31.16 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  36.18 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  26.41 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  31.09 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  31.43 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1076  Nucleoside phosphorylase  31.65 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.87 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  33.14 
 
 
657 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  28.03 
 
 
264 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  33.79 
 
 
497 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.37 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  23.63 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0302  purine phosphorylases family protein 1  30.58 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0124771  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0220  MTA/SAH nucleosidase  27.61 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  26.38 
 
 
231 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  26.39 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.33 
 
 
237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  36 
 
 
217 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.01 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04820  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.61 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231071  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  24.87 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.97 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.32 
 
 
458 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.33 
 
 
466 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.34 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  24.87 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.2 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.23 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  21.88 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.92 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.33 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  34.57 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  28.99 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.02 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  28.66 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.64 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.32 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.52 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.32 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1616  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.67 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0606  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.63 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  25.96 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  27.67 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.82 
 
 
232 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  27.04 
 
 
236 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>