112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0061 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  100 
 
 
242 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  42.01 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  39.52 
 
 
237 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  40.64 
 
 
235 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  41.01 
 
 
215 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  38.5 
 
 
235 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  38.5 
 
 
235 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  36 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  39.88 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  37.87 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  39.88 
 
 
225 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  39.88 
 
 
225 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  39.88 
 
 
225 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  37.96 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  36.74 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  41.21 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  41.14 
 
 
235 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  41.71 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  37.56 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  37.56 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  39.43 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  36.45 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  40.33 
 
 
235 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  36.52 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  42.13 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  33.64 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  38.57 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  40.16 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  39.91 
 
 
244 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  40.38 
 
 
221 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  33.64 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  39.02 
 
 
216 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  32.71 
 
 
236 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  36.88 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  33.18 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  31.28 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  36 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  35.71 
 
 
237 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  35.71 
 
 
237 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  34.58 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  32.16 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  38.16 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  26.52 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  28.93 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.83 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  33.67 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  27.91 
 
 
229 aa  55.5  0.0000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  33.14 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  28.5 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  37.32 
 
 
497 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  32.2 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.08 
 
 
657 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.18 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.77 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  29.7 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  28.93 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  33.56 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.44 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.1 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.14 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0602  methylthioadenosine nucleosidase  24.54 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.16 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.66 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.54 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.83 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.48 
 
 
233 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.54 
 
 
231 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  29.94 
 
 
234 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14421  nucleoside phosphorylase  24.4 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  26.95 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.18 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.18 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.11 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.32 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.22 
 
 
231 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.16 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.49 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.14 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24 
 
 
466 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  29.08 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04820  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.19 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231071  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.49 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  22.82 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.73 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.33 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1076  Nucleoside phosphorylase  27.49 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.68 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.49 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.75 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.49 
 
 
459 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  22.67 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>