21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1216 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  45.85 
 
 
248 aa  204  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  46.35 
 
 
250 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4823  purine or other phosphorylase family 1  47.11 
 
 
248 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00149487  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  38.77 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  38.77 
 
 
244 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  29.1 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0765  MTA/SAH nucleosidase  22.11 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0961162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  29.14 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  29.77 
 
 
276 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  26.15 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  24.62 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  28.03 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1054  Adenosylhomocysteine nucleosidase  22.22 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  26.96 
 
 
208 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  28.46 
 
 
257 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.28 
 
 
227 aa  45.1  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11070  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.43 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0308567  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  19.57 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  28.79 
 
 
246 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.52 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>