82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1727 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  87.76 
 
 		 246 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  83.81 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  71.66 
 
 		 243 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  70.32 
 
 		 236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  68.95 
 
 		 276 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  65.83 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  45.75 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  45.28 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  44.74 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  44.81 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  45.16 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  41.31 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  41.2 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  37.38 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  40.53 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  37.74 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  37.38 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  37.26 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  37.31 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  40.98 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  36.67 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  35.92 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  36.19 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  36.32 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  34.11 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  34.11 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  40.67 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  31.19 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  31.19 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  33.18 
 
 		 218 aa  88.6  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  36.87 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  31.16 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  31.94 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  35.56 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  40.91 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  30.77 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  33.9 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  32.86 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.43 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30.71 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.43 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.43 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.43 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.43 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  26.35 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  31.33 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  24.59 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.43 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.91 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  28.79 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.35 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.67 
 
 		 657 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  28.65 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  27.07 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4823  purine or other phosphorylase family 1  28.4 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00149487  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  25.97 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  27.85 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.53 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  39.01 
 
 		 497 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  26.87 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  31.67 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.12 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.62 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.08 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.21 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  25.97 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0384  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.65 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.799751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.16 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  32.35 
 
 		 498 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0526  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.34 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2638  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.4 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.316636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  26.62 
 
 		 255 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>