80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3769 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  100 
 
 		 230 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  96.52 
 
 		 230 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  88.74 
 
 		 227 aa  340  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  63.18 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  60.91 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  60.17 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  47.66 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  49.29 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  46.26 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  45.28 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  45.75 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  44.55 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  45.97 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  43.05 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  43.15 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  42.6 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  39.91 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  40.38 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  41.01 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  41.01 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  43.78 
 
 		 221 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  40.09 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  38.71 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  40.55 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  40.85 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  39.22 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  37.79 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  38.97 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  38.97 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  38.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  38.5 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  38.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  38.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  38.5 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  38.5 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  39.13 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  45.03 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  41.01 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  31.46 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  33.97 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  33.97 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  36.14 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  40.51 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  31.61 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  34.34 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  28.93 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  30.61 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.91 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  27.27 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1616  adenosylhomocysteine nucleosidase  31.16 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1682  adenosylhomocysteine nucleosidase  31.16 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  28.14 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  28.16 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  33.08 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  32.97 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.35 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  38.73 
 
 		 657 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.1 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.27 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  39.19 
 
 		 497 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.36 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.03 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.79 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.34 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  26.52 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0220  MTA/SAH nucleosidase  28.08 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.19 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  66.67 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  28.16 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3407  AMP nucleosidase  30.35 
 
 		 389 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474921  hitchhiker  0.0063394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.69 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.82 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.49 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1076  Nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.46 
 
 		 458 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  34.62 
 
 		 279 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  34.62 
 
 		 279 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1698  hypothetical protein  40.16 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438132  hitchhiker  0.00014053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.69 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>