58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3157 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  57.21 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  44.95 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  45.41 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  44.39 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  44.95 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  44.95 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  45.37 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  50.3 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  46.88 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  42.04 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  44.64 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  44.8 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  44.64 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  44.64 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  44.59 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  43.81 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  48.85 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  44.34 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  44.14 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  43.95 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  43.5 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  44.81 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  42.33 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  42.53 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  41.82 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  43.81 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  37.39 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  44.39 
 
 		 258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  42.15 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  39.91 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  40.11 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  39.81 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  40.24 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  40.55 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  35.68 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  41.73 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  35.39 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  37.33 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  33.97 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  32.75 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  32.75 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  33.13 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0867  purine phosphorylase family protein 1  37.78 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  27.95 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  30.64 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  27.95 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  30.85 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  28.25 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  29.89 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  24.49 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.96 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  31.3 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0302  purine phosphorylases family protein 1  31.55 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0124771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  25.76 
 
 		 230 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  24.76 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>