45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1489 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  98.72 
 
 
235 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  99.11 
 
 
225 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  99.56 
 
 
225 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  98.67 
 
 
225 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  98.67 
 
 
225 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  98.67 
 
 
225 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  94.04 
 
 
235 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  82.22 
 
 
235 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  81.78 
 
 
235 aa  348  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  81.78 
 
 
234 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  80 
 
 
235 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  80 
 
 
235 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  80 
 
 
235 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  78.63 
 
 
234 aa  330  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  73.39 
 
 
243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  71.74 
 
 
243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  75.11 
 
 
237 aa  298  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  47.85 
 
 
215 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  44.5 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  43.63 
 
 
221 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  43.36 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  41.47 
 
 
258 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  37.14 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  40.38 
 
 
227 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  41.01 
 
 
246 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  41.94 
 
 
244 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  36.74 
 
 
276 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  36.45 
 
 
236 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  34.11 
 
 
246 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  38.5 
 
 
230 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  37.56 
 
 
230 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  38.64 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  34.11 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  36.93 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  32.59 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  40 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  39.29 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  36.46 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  33.68 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  33.68 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  35.37 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  35.75 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  32.03 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  34.57 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>