46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4557 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  98.3 
 
 
235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  98.3 
 
 
235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  91.06 
 
 
235 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  90.64 
 
 
235 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  94.81 
 
 
234 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  89.66 
 
 
234 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  79.11 
 
 
235 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  80 
 
 
235 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  79.46 
 
 
225 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  79.02 
 
 
225 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  78.67 
 
 
235 aa  317  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  78.57 
 
 
225 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  78.57 
 
 
225 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  78.57 
 
 
225 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  72.44 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  71.11 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  70.18 
 
 
237 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  46.12 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  45.71 
 
 
215 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  42.44 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  41.85 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  40.83 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  41.47 
 
 
230 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  42.4 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  40.55 
 
 
230 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  41.94 
 
 
227 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  40.99 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  38.32 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  36.57 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  37.21 
 
 
276 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  36.24 
 
 
236 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  42.01 
 
 
216 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  37.44 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  34.48 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  33.64 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  40.8 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  41.67 
 
 
257 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  36.07 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  36.07 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  33.73 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  36.07 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  31.94 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  33.71 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  32.93 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  29.46 
 
 
250 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>