61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6343 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  86.99 
 
 		 246 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  64.1 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  61.82 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  63.18 
 
 		 227 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  60 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  50.23 
 
 		 276 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  47.47 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  44.7 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  48.87 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  45.62 
 
 		 247 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  44.16 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  45.16 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  41.28 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  41.28 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  46.57 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  42.66 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  42.06 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  42.66 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  41.28 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  41.28 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  40.99 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  41.44 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  41.15 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  40.74 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  40.81 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  40.74 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  40.99 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  40.93 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  41.76 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  34.17 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  35.41 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  37.2 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  37.63 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  36.75 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  37.5 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  28.64 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  28.64 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  31.45 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.35 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0526  Adenosylhomocysteine nucleosidase  30.88 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  27.27 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  30.32 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  29.27 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  30.73 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.09 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0302  purine phosphorylases family protein 1  36.36 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0124771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.29 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.65 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0497  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.33 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.36672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  24.79 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  28.57 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  39.33 
 
 		 657 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  33.97 
 
 		 497 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0867  purine phosphorylase family protein 1  25.29 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>