148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1743 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
286 aa  579  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  33.33 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  31.82 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.27 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.52 
 
 
232 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  27.08 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  30.25 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0112  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.53 
 
 
229 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0152  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.53 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00286407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0205  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.02 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.56 
 
 
215 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0855  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.67 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1905  purine or other phosphorylase family 1  30.69 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  30.86 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.26 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.26 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  27.45 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  31.25 
 
 
231 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  29.25 
 
 
215 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  27.59 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0124  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.02 
 
 
228 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0287728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  36.46 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4743  MTA/SAH nucleosidase  27.4 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.24 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1115  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.37 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.35 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4916  purine phosphorylase family 1  24.44 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0510637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  31.35 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1322  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
236 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.25 
 
 
231 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1001  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3850  purine phosphorylase family 1  24.44 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1055  phosphorylase  30.85 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  29.52 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.02 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
228 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  27.27 
 
 
249 aa  55.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  28.14 
 
 
235 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0706  methylthioadenosine nucleosidase  37.63 
 
 
224 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.427184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3050  purine phosphorylase family 1  31.07 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0212043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  26.2 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2966  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.6 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0384  Adenosylhomocysteine nucleosidase  22.47 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.799751  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1564  purine phosphorylase family 1  24.88 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  28.92 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0361  purine or other phosphorylase family 1  24.9 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.35 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  27.98 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0867  purine phosphorylase family protein 1  22.77 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2659  Adenosylhomocysteine nucleosidase  30.61 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00656032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17250  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.35 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2956  methylthioadenosine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0322899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1217  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.87 
 
 
230 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.6 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  25.31 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.603402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 
228 aa  53.1  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1176  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.633739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1220  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.37 
 
 
236 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  27.09 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  22.75 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01241  putative MTA/SAH nucleosidase  32.53 
 
 
251 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.214257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  32.2 
 
 
242 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.88 
 
 
231 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.04 
 
 
237 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.04 
 
 
466 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11070  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.45 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0308567  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3705  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase, putative  36.26 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  27 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.74 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0828  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.61 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.9 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  25.93 
 
 
243 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  32.26 
 
 
235 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  22.6 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  30.22 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.48 
 
 
458 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.93 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  33.33 
 
 
233 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.48 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  29.29 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3574  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.07 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  29.17 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4313  adenosylhomocysteine nucleosidase  32.26 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.48 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  27.27 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.48 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.48 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0920  methylthioadenosine nucleosidase  30.85 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.103571  normal  0.199086 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0971  purine nucleoside phosphorylase  25.15 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2076  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.44 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.806649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  31.85 
 
 
657 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1589  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.73 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>