51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1824 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  457  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  46.54 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  38.24 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  38.54 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  38.7 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  40.2 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  41.2 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  36.45 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  36.59 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  40.28 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  36.45 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  44.44 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  39.87 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  38.24 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  37.34 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  39 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  40.25 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  36.76 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  36.04 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  35.11 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  35.11 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  34.22 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  37.5 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  35.92 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  33.77 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  33.18 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  33.18 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  32.74 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  36.57 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  35.2 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  36.57 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  34.72 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  35.43 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  35.43 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  32.84 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  35.43 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  35.43 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  25.58 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  32.11 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  32.11 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  32.16 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  38.62 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  32.58 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  29.36 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  36.99 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  26.56 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  26.52 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  31.58 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  32.89 
 
 		 274 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>