70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2681 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  91.77 
 
 		 276 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  72.49 
 
 		 243 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  69.58 
 
 		 246 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  70.18 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  70.32 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  66.18 
 
 		 216 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  48.6 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  47.66 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  48.11 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  45.79 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  48.39 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  47.47 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  37.95 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  41.5 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  37.95 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  42.31 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  39.53 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  39.62 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  42.04 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  40.91 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  38.68 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  38.99 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  37.38 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  36.45 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  35.78 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  35.78 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  36.24 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  36.45 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  36.87 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  35.68 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  35.68 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  35.68 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  35.68 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  35.68 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  39.07 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  36.02 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  33.52 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  32.56 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  29.06 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  29.06 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  34.68 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  34.56 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  34.62 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  32.93 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  28.12 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  25.41 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  28.03 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  31.36 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.29 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.29 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.57 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  23.6 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.29 
 
 		 459 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.93 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.29 
 
 		 459 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  39.85 
 
 		 657 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  24.68 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.95 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.52 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.52 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.17 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.17 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.57 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  28.68 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.83 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  36.43 
 
 		 497 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.29 
 
 		 466 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30 
 
 		 458 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.73 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>