57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0413 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  417  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  45.14 
 
 
246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  42.86 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  44.85 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  37.58 
 
 
235 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  39.13 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  32.29 
 
 
246 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  36.06 
 
 
276 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  35.03 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  37.73 
 
 
235 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  37.68 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  36.02 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  34.11 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  34.11 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  35.94 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  33.64 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  33.64 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  34.11 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  35.71 
 
 
243 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  34.3 
 
 
243 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  33.64 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  37.2 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  33.94 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  34.58 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  36.99 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  38.15 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  38.15 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  38.15 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  34.6 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  38.15 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  35.9 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  37.57 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  36.93 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  37.57 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  33.18 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  33.18 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  34.42 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  35.38 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  36.84 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  34.03 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  34.29 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  31.82 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  39.44 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  29.05 
 
 
258 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  27.32 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  25.99 
 
 
260 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  31.68 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  26.24 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  26.7 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  26.7 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  35.59 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  25.77 
 
 
274 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  27.81 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.28 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.79 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.87 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.04 
 
 
266 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>