73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3461 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  96.52 
 
 		 230 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  86.49 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  61.82 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  59.09 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  60 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  45.79 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  44.39 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  47.39 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  44.34 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  43.95 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  45.97 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  44.81 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  43.6 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  42.13 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  40.85 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  41.31 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  40.09 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  41.94 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  41.94 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  41.7 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  41.47 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  38.25 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  43.28 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  40.85 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  38.24 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  37.33 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  37.22 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  37.56 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  37.68 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  43.79 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  42.13 
 
 		 242 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  31.91 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  36.14 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  33.01 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  40.51 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  33.01 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  31.37 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  28.93 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  35.61 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1616  adenosylhomocysteine nucleosidase  31.88 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1682  adenosylhomocysteine nucleosidase  31.88 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.91 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.17 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1897  MTA/SAH nucleosidase, putative  29.08 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  32.31 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.4 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.55 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  27.59 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.71 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  33.94 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.03 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  27.1 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.95 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.63 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.94 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1698  hypothetical protein  39.53 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438132  hitchhiker  0.00014053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.36 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.84 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  72 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  28.23 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  36.94 
 
 		 497 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.23 
 
 		 458 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  26.7 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.69 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  37.93 
 
 		 657 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3407  AMP nucleosidase  30.85 
 
 		 389 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474921  hitchhiker  0.0063394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>