98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4260 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  86.12 
 
 		 246 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  84.45 
 
 		 246 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  70.85 
 
 		 243 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  70.18 
 
 		 236 aa  317  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  68.81 
 
 		 276 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  65.83 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  45.97 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  46.08 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  44.55 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  45.62 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  43.6 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  42.99 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  37.96 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  38.42 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  34.82 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  34.51 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  35.27 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  40.49 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  38.33 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  33.63 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  39.63 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  35.29 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  34.05 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  34.05 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  34.07 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  34.48 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  33.94 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  32.59 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  32.59 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  29.82 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  29.82 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  35.75 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  30.15 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  34.76 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  37.5 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  33.53 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  25.54 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  25.54 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  30.73 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  29.14 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  28.4 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  37.75 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  28.29 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.97 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  27.54 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.33 
 
 		 466 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2964  purine phosphorylase family 1  27.22 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000521815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  26.78 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.72 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.15 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.87 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.4 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4823  purine or other phosphorylase family 1  28.4 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00149487  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.08 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.1 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.17 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.87 
 
 		 459 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.87 
 
 		 459 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.43 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.79 
 
 		 458 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  41.01 
 
 		 657 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3574  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.78 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.58 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.24 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.7 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  30.6 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  29.66 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.66 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1564  purine phosphorylase family 1  26.88 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.66 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.45 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1054  Adenosylhomocysteine nucleosidase  30.23 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  36.69 
 
 		 497 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.45 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11070  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.5 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0308567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.29 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.63 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  28.48 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1742  purine phosphorylases family protein 1  30 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.41 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.03 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  25.32 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.15 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0112  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.84 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0152  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.84 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00286407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.06 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  30.95 
 
 		 498 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.44 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.15 
 
 		 231 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0124  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.03 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0287728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>