76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1721 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  73.93 
 
 		 246 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  72.49 
 
 		 236 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  70.85 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  71.17 
 
 		 276 aa  321  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  73.19 
 
 		 246 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  68.47 
 
 		 216 aa  264  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  49.77 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  49.76 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  49.29 
 
 		 230 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  47.47 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  47.39 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  46.23 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  40.28 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  37.99 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  38.57 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  41.75 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  37.22 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  40.44 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  36.77 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  37.44 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  40.3 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  38.79 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  38.97 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  37.85 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  37.85 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  38.32 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  37.61 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  37.14 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  36.92 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  36.15 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  36.15 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  36.15 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  36.15 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  36.15 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  38.93 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  31.53 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  31.53 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  34.3 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  37.85 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  29.65 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  37.01 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  31.61 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  34.5 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  36.54 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.71 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  23.08 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.05 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  26.15 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  32.59 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  27.56 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.28 
 
 		 458 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  25.64 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.28 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25.14 
 
 		 466 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0877  purine or other phosphorylase family 1  27.92 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.729819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.59 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.59 
 
 		 459 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.59 
 
 		 459 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.9 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  31.76 
 
 		 498 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.27 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  42.02 
 
 		 657 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.61 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  24.06 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.54 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.97 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  25 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  30.67 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0824  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  36.96 
 
 		 497 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  26.21 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.73 
 
 		 258 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.1 
 
 		 279 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.1 
 
 		 279 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>