252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1429 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  35.24 
 
 
253 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  38.33 
 
 
244 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  37.42 
 
 
253 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  32.74 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  33.97 
 
 
248 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  31.02 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  38.16 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  31.88 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  33.99 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  32.24 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  31.82 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  32.16 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  29.06 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  29.19 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  29.35 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  26.4 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  32.26 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  31.82 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  28.65 
 
 
236 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  31.17 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  34.84 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  26.63 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  29.7 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  28.29 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  28.95 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  29.02 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  26.09 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  30.86 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  28.66 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  31.82 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  26.09 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  31.93 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  31.82 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  30.54 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  29.7 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  26.88 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  26.88 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1925  purine nucleoside phosphorylase  28.12 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  33.88 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  29.68 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  25.37 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  25.79 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  28.99 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0203  purine nucleoside phosphorylase  29.74 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  25.67 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  26.49 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  26.63 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  26.14 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0231  purine nucleoside phosphorylase  29.53 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691256  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  26.7 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  28.67 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  26.74 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  28.5 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  28.5 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  28.5 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  28.5 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  28.66 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  27.67 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  27.67 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  26.32 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  30.12 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  28.73 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  27.57 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  27.32 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  27.72 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  28.04 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  28.04 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  28.04 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  23.47 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  27.32 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  27.32 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  28.04 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3612  purine nucleoside phosphorylase  27.08 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  29.45 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  30.41 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  27.04 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  26.78 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  26.51 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  27.62 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  28.82 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  30.41 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  27.72 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  27.72 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  28.18 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2357  purine or other phosphorylase family 1  25.68 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  29.65 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  23.79 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  26.78 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>