More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1578 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1578  ABC transporter related  100 
 
 		 561 aa  1108    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00291394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  28.3 
 
 		 572 aa  209  8e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  24.39 
 
 		 622 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.96 
 
 		 608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.58 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.01 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.51 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.01 
 
 		 586 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  27.92 
 
 		 586 aa  194  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.11 
 
 		 622 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.94 
 
 		 720 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.13 
 
 		 586 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  23.54 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.87 
 
 		 595 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.67 
 
 		 586 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  27.25 
 
 		 688 aa  190  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.29 
 
 		 586 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  24.15 
 
 		 618 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  22.93 
 
 		 626 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  26.86 
 
 		 712 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.86 
 
 		 971 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  25.71 
 
 		 599 aa  187  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  26.78 
 
 		 739 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  25.04 
 
 		 578 aa  187  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.54 
 
 		 578 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  27.55 
 
 		 622 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  25.49 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.69 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.57 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.31 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.53 
 
 		 741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  23.19 
 
 		 635 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.91 
 
 		 617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  22.51 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  25.66 
 
 		 681 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.54 
 
 		 580 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  23.02 
 
 		 613 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.05 
 
 		 629 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  24.65 
 
 		 594 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  28.36 
 
 		 726 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  22.89 
 
 		 627 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  22.89 
 
 		 627 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.44 
 
 		 595 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.23 
 
 		 593 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  25.44 
 
 		 587 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  24.69 
 
 		 600 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.24 
 
 		 583 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  26.02 
 
 		 572 aa  183  9.000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  25.87 
 
 		 720 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.05 
 
 		 725 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  26.18 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.87 
 
 		 634 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.05 
 
 		 614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  27.44 
 
 		 726 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.94 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  23.99 
 
 		 594 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  23.39 
 
 		 588 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.49 
 
 		 593 aa  180  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  25.96 
 
 		 594 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  27.38 
 
 		 645 aa  180  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  25.13 
 
 		 594 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 		 720 aa  180  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  25.26 
 
 		 602 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.63 
 
 		 590 aa  180  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  25.75 
 
 		 586 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  22.87 
 
 		 619 aa  180  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.67 
 
 		 1003 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  25.46 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  25.78 
 
 		 760 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  27.92 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.95 
 
 		 574 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.95 
 
 		 574 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.95 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  25.96 
 
 		 608 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  24.18 
 
 		 641 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.95 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.95 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  23.5 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  25.17 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  24.95 
 
 		 580 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  24.13 
 
 		 593 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  26.68 
 
 		 584 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  27.69 
 
 		 930 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.83 
 
 		 586 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  23.82 
 
 		 605 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.95 
 
 		 596 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.95 
 
 		 596 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.08 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.54 
 
 		 582 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  27.85 
 
 		 699 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  25.81 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  23.31 
 
 		 601 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  23.91 
 
 		 640 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  25.54 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  25.92 
 
 		 814 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  30.02 
 
 		 742 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.9 
 
 		 632 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  25.92 
 
 		 768 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>