More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3606 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3606  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 355 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.76 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.39 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.47 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.86 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  39.4 
 
 		 336 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  33.06 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2199  LacI family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.585531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.7 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.97 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  35.45 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  36.97 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  36.07 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4950  putative LacI family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213435  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.74 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6517  putative transcriptional regulator, LacI family protein  36.55 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2332  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302779  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.03 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.14 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  31.73 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 346 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  31.34 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.23 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  35.02 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.76 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.39 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.76 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.76 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.76 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1104  periplasmic sugar binding transcriptional regulator  33 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.33 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  36.09 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  28.95 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  36.69 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.37 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  36 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.39 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  32.21 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  32.5 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  31.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.48 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  31.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.48 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.34 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.48 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.87 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>