More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3082 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
170 aa  357  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  75.9 
 
 
180 aa  276  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.12 
 
 
180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  73.49 
 
 
180 aa  267  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  77.42 
 
 
178 aa  254  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.42 
 
 
158 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.76 
 
 
166 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  60.76 
 
 
166 aa  201  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.24 
 
 
174 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.94 
 
 
194 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.32 
 
 
163 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.41 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.14 
 
 
119 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.7 
 
 
158 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.03 
 
 
240 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.87 
 
 
168 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.59 
 
 
169 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.67 
 
 
169 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.38 
 
 
169 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 
157 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.49 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.01 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.42 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  41.29 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.37 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.9 
 
 
176 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  34.38 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.77 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.38 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.38 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.04 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.64 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  33.33 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.85 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  33.54 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  32.39 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.19 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  38.46 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.79 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.16 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.72 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.88 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  32.9 
 
 
564 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.95 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  32.14 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.85 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.41 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.14 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  38.14 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.36 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.36 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.78 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.33 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.08 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.78 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.82 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  37.5 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.76 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.2 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.36 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  38.05 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.89 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.04 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.81 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.04 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.99 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.69 
 
 
189 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.55 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.85 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.13 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
361 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
361 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  36 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.35 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.45 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.03 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.45 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.64 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  31.34 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.45 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.35 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.04 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  37.11 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.08 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  35.71 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.75 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.64 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.04 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.03 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.47 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.86 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  40 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.8 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>