More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0120 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  100 
 
 
161 aa  335  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.75 
 
 
161 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 
160 aa  186  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.64 
 
 
160 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  51.95 
 
 
163 aa  160  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.45 
 
 
158 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.75 
 
 
160 aa  156  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  49.02 
 
 
157 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  47.1 
 
 
176 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.16 
 
 
214 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50 
 
 
190 aa  144  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.87 
 
 
211 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  44.97 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.7 
 
 
150 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.67 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.94 
 
 
183 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.05 
 
 
159 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.62 
 
 
159 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  39.62 
 
 
159 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.45 
 
 
155 aa  133  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.81 
 
 
155 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.77 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.23 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.53 
 
 
163 aa  127  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.26 
 
 
159 aa  114  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  38.26 
 
 
151 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  43.41 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.42 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.7 
 
 
161 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.02 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.72 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  40 
 
 
156 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  36 
 
 
151 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  48.62 
 
 
148 aa  105  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  47.66 
 
 
186 aa  103  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.79 
 
 
158 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.5 
 
 
158 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  34.07 
 
 
188 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  37.09 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.26 
 
 
157 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  48.57 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  37.74 
 
 
158 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  36.48 
 
 
167 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.15 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  48.54 
 
 
193 aa  97.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  35.33 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
301 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.47 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  42.34 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.61 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.52 
 
 
190 aa  94  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  45.1 
 
 
182 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.23 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.54 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.42 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  45.53 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.45 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.11 
 
 
188 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  46 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.34 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  37.11 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  44.23 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.82 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.17 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.95 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  40.52 
 
 
168 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.24 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.98 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.48 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  43.48 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.48 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.48 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.05 
 
 
187 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.38 
 
 
223 aa  88.2  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.12 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  42 
 
 
148 aa  87.8  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  42 
 
 
148 aa  87.8  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.91 
 
 
158 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  45.45 
 
 
164 aa  87.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.65 
 
 
156 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.25 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  40.68 
 
 
196 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.82 
 
 
181 aa  87  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.16 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.75 
 
 
161 aa  87  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.65 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.94 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.13 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.35 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.65 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  33.99 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0231  hypothetical protein  42.57 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.97 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>