More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1141 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  67.53 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.24 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.39 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.75 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.75 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.06 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.15 
 
 		 223 aa  157  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.66 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.39 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.16 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  45.45 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  55 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.4 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.48 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  38.99 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.99 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.7 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.55 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.91 
 
 		 183 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.17 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  42.21 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.69 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.71 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.61 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.87 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  40.3 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.65 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.1 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  45.53 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.41 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  50.52 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  37.25 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.51 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  36.36 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.15 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.98 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  40.62 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.06 
 
 		 301 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  35.29 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  42.86 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.69 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  40.91 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.54 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  42.68 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  32.43 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.83 
 
 		 214 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  41.44 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.3 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  39.1 
 
 		 171 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.51 
 
 		 188 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.61 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  37.42 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.64 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.08 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  40.88 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.62 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  45.08 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.98 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.97 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.47 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  44.66 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  43.86 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.42 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.3 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  45.1 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.96 
 
 		 484 aa  87.8  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  42.57 
 
 		 200 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.02 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.42 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  42.57 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  42.57 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  39.34 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.55 
 
 		 142 aa  85.1  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.92 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 182 aa  84.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.51 
 
 		 475 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.86 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.68 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.75 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.03 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.46 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.04 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.31 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.06 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.24 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  46 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  45.36 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.93 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.81 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.73 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  41.59 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>