More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2072 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
161 aa  328  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  66.23 
 
 
186 aa  207  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.33 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  64.05 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.05 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.82 
 
 
164 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.29 
 
 
155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54 
 
 
155 aa  158  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.67 
 
 
150 aa  157  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 
223 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  57.05 
 
 
158 aa  151  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.51 
 
 
160 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  48.08 
 
 
157 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  45.45 
 
 
163 aa  147  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.96 
 
 
163 aa  146  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.41 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.94 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.35 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.75 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.11 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.29 
 
 
183 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  40.91 
 
 
159 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.91 
 
 
159 aa  136  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.33 
 
 
155 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.65 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.61 
 
 
161 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  40.4 
 
 
154 aa  130  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  51.2 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.48 
 
 
161 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.98 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  43.38 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  48.95 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.66 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  53.1 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  48.33 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.04 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.56 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.33 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  44.74 
 
 
149 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.67 
 
 
159 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  43.97 
 
 
148 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  44.74 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  41.61 
 
 
156 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.79 
 
 
147 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.76 
 
 
152 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.37 
 
 
157 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.79 
 
 
190 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.1 
 
 
163 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  36.67 
 
 
188 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  44 
 
 
193 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.88 
 
 
301 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  41.67 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  40 
 
 
151 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  40.35 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  40.35 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  40.88 
 
 
164 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  44.72 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 
188 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.27 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.76 
 
 
190 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  41.8 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  43.9 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.9 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.74 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.1 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.23 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  42.74 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.86 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.22 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  41.58 
 
 
187 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.78 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.09 
 
 
174 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  35.06 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  41.58 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  41.58 
 
 
200 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  35.06 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.57 
 
 
148 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.11 
 
 
164 aa  89  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.26 
 
 
153 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.88 
 
 
152 aa  89  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.5 
 
 
190 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  38.35 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.22 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.81 
 
 
177 aa  87.8  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  40.74 
 
 
222 aa  87.8  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
169 aa  87.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  46.39 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.99 
 
 
155 aa  87.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.59 
 
 
153 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.91 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.69 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  47.47 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  37.69 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.88 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>