More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2603 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.14 
 
 
162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.44 
 
 
223 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  62.33 
 
 
148 aa  191  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  62.33 
 
 
148 aa  191  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  60.54 
 
 
165 aa  185  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.18 
 
 
164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  59.59 
 
 
222 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  65.44 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  58.5 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.22 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.79 
 
 
168 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.85 
 
 
176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 
200 aa  180  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.59 
 
 
154 aa  180  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 
200 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.67 
 
 
166 aa  179  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 
187 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.73 
 
 
152 aa  179  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.18 
 
 
170 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.11 
 
 
182 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.11 
 
 
182 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  60.54 
 
 
168 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
167 aa  178  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
178 aa  177  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  61.27 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  58.74 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.74 
 
 
167 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
167 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  55.97 
 
 
183 aa  177  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.82 
 
 
178 aa  177  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.41 
 
 
461 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  59.59 
 
 
163 aa  176  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.7 
 
 
175 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  58.04 
 
 
167 aa  176  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
169 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  58.5 
 
 
177 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.11 
 
 
152 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.82 
 
 
177 aa  174  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
172 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  58.74 
 
 
172 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.5 
 
 
158 aa  174  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  58.9 
 
 
168 aa  174  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.16 
 
 
175 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  58.04 
 
 
172 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  58.04 
 
 
172 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  59.86 
 
 
158 aa  173  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  58.04 
 
 
172 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.16 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.53 
 
 
189 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.96 
 
 
252 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.16 
 
 
174 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60 
 
 
361 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.9 
 
 
484 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  60.96 
 
 
222 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.69 
 
 
361 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.26 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.38 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.9 
 
 
174 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  56.64 
 
 
158 aa  169  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.96 
 
 
411 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  56.08 
 
 
151 aa  168  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.46 
 
 
159 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  51.61 
 
 
182 aa  168  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  55.77 
 
 
170 aa  167  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  61.9 
 
 
182 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  54.93 
 
 
164 aa  167  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  61.9 
 
 
182 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  54 
 
 
189 aa  167  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  61.84 
 
 
162 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
167 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.11 
 
 
142 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.97 
 
 
163 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.15 
 
 
150 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  57.82 
 
 
169 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  56.12 
 
 
177 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.38 
 
 
177 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  51.7 
 
 
193 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.45 
 
 
151 aa  164  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  60.63 
 
 
169 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.11 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.64 
 
 
231 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  54.25 
 
 
205 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  61.9 
 
 
151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.52 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  56.16 
 
 
152 aa  160  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.7 
 
 
166 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  51.41 
 
 
182 aa  160  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.19 
 
 
363 aa  160  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.41 
 
 
190 aa  160  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.22 
 
 
194 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.44 
 
 
158 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 
160 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.6 
 
 
179 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.7 
 
 
187 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.85 
 
 
482 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  49.36 
 
 
177 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>