More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3264 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
211 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.33 
 
 
214 aa  297  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  77.22 
 
 
176 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  67.95 
 
 
164 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.2 
 
 
160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.38 
 
 
160 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  43.87 
 
 
161 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.22 
 
 
160 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.76 
 
 
150 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.4 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  42.5 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.49 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.52 
 
 
158 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.38 
 
 
155 aa  124  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  42.75 
 
 
157 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.49 
 
 
183 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.38 
 
 
163 aa  117  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.36 
 
 
157 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.48 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  36.48 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.57 
 
 
161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.25 
 
 
155 aa  109  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  37.59 
 
 
154 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.82 
 
 
155 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.73 
 
 
159 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.54 
 
 
164 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.71 
 
 
159 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.09 
 
 
157 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.08 
 
 
164 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.95 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.6 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  38.41 
 
 
158 aa  96.3  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.17 
 
 
158 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  37.14 
 
 
149 aa  95.5  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.73 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  53.57 
 
 
186 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  48.96 
 
 
148 aa  92.8  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.66 
 
 
163 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  36.23 
 
 
156 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  41.41 
 
 
153 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.86 
 
 
163 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  32.61 
 
 
155 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  28.88 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.88 
 
 
148 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.56 
 
 
161 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.21 
 
 
141 aa  85.1  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.74 
 
 
157 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  40.87 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.63 
 
 
161 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.63 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.81 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.94 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.38 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
149 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  33.58 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.44 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.72 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.12 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  40 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.58 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.24 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  49.47 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
147 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.94 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0476  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.3 
 
 
145 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.44 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
158 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
147 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.98 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.57 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.14 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  33.55 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.27 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.87 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  40.82 
 
 
148 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.21 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  46.43 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.37 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.1 
 
 
142 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.22 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.21 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4585  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.74 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.639578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  46.25 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.53 
 
 
143 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  36.94 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  36.94 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.89 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>