More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5383 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 
152 aa  308  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  71.92 
 
 
147 aa  196  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.18 
 
 
155 aa  173  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.42 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  54.05 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.05 
 
 
157 aa  155  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.69 
 
 
163 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  53.49 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  51.15 
 
 
151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.59 
 
 
158 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  42.54 
 
 
153 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.91 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.2 
 
 
156 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.91 
 
 
153 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 
152 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.18 
 
 
153 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.44 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.25 
 
 
155 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.44 
 
 
163 aa  114  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.2 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.46 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.67 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.78 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  38.97 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.54 
 
 
223 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.71 
 
 
161 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.76 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.54 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
183 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  39.26 
 
 
163 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
161 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.31 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.03 
 
 
164 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  49.62 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.5 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  37.4 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.13 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  32.45 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  32.45 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.98 
 
 
190 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.5 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  43.36 
 
 
186 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.21 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.61 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  33.61 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  40.38 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.34 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  34.78 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  40.38 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.79 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.98 
 
 
188 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  41.67 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.38 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  37.61 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.62 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  37.7 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  43.7 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.88 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  31.17 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.86 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.31 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.64 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.84 
 
 
176 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.42 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4585  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.68 
 
 
178 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.639578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.24 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.83 
 
 
484 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.3 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0003  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.16 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.3 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.27 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.27 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  38.79 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  36.59 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.46 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.26 
 
 
361 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  36.59 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.26 
 
 
361 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.42 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.52 
 
 
524 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  42 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  41.49 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.16 
 
 
301 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.86 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.78 
 
 
521 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.42 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.83 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.3 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.68 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  34.06 
 
 
298 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  36.13 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.14 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  34.41 
 
 
177 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>