More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2061 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
158 aa  309  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.33 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  60.78 
 
 
186 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  61.39 
 
 
158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.5 
 
 
164 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.59 
 
 
164 aa  157  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  44.87 
 
 
163 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.79 
 
 
163 aa  150  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.3 
 
 
150 aa  148  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.25 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.68 
 
 
158 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  41.33 
 
 
157 aa  144  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.36 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  55.03 
 
 
158 aa  143  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
223 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.36 
 
 
183 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.28 
 
 
158 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
160 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.03 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.24 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  35.76 
 
 
154 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.31 
 
 
159 aa  121  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
155 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  36.81 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.62 
 
 
157 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  51.77 
 
 
157 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.4 
 
 
159 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.67 
 
 
161 aa  116  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.11 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  40.27 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  38.31 
 
 
156 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.56 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.01 
 
 
160 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 
155 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  38.76 
 
 
148 aa  106  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.99 
 
 
156 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.46 
 
 
153 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  40.52 
 
 
155 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.78 
 
 
152 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  40.5 
 
 
161 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
153 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.52 
 
 
301 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.73 
 
 
153 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.28 
 
 
190 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.1 
 
 
153 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.12 
 
 
163 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.17 
 
 
211 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  35.17 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  34.21 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
214 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  37.72 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.51 
 
 
188 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  48.45 
 
 
176 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  28.57 
 
 
188 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.03 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  33.79 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.76 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  44.44 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  29.61 
 
 
154 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  29.61 
 
 
154 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.34 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.22 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.49 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  42.31 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.92 
 
 
484 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.8 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  35.05 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.88 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.81 
 
 
153 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  40.91 
 
 
164 aa  84  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.6 
 
 
157 aa  84  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  43.12 
 
 
164 aa  84  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.6 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.09 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.16 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.67 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.12 
 
 
461 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  47.75 
 
 
186 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.27 
 
 
524 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.95 
 
 
193 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.73 
 
 
361 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
361 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  37.14 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  37.14 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  37.14 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  46.39 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.9 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.94 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.4 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.25 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.4 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.21 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  40.62 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  44.55 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.32 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>