More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4858 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
167 aa  350  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  72.08 
 
 
155 aa  239  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  56.49 
 
 
154 aa  200  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  56.49 
 
 
154 aa  200  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10843  deaminase  73.55 
 
 
140 aa  183  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.52974e-17  hitchhiker  0.000000121156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  42 
 
 
157 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.22 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  37.58 
 
 
156 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.74 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  38.41 
 
 
151 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.27 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.66 
 
 
161 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.97 
 
 
163 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  36.42 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.18 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.51 
 
 
158 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.71 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.1 
 
 
159 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  35.1 
 
 
159 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.42 
 
 
157 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.99 
 
 
163 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 
158 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.26 
 
 
157 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  34.42 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.23 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  36.48 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 
160 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  39.01 
 
 
186 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.61 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.14 
 
 
223 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.21 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.82 
 
 
153 aa  94  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.42 
 
 
160 aa  94  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.93 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.82 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  32.89 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.16 
 
 
190 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  35.62 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.74 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.68 
 
 
161 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.11 
 
 
155 aa  90.5  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.32 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.4 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.25 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  31.13 
 
 
149 aa  87.4  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.94 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.47 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  36.73 
 
 
148 aa  85.9  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.23 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  30.72 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.39 
 
 
214 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  35.82 
 
 
176 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  41.44 
 
 
158 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.13 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.36 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.67 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  47.13 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  43.62 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.58 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.96 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.07 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.24 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  30.81 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.29 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.58 
 
 
521 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.93 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.47 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.32 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.49 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.27 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.86 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.86 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  39.58 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.47 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  43.33 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.02 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.89 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.05 
 
 
484 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.38 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.39 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.42 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  38.95 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.68 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  33.78 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  43.9 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  42.11 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  37.89 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.3 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.18 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.48 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.53 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>