More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0085 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.12 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.61 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  46.38 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  45.45 
 
 		 148 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.39 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.03 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.14 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.58 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.1 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.48 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.78 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.61 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.76 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0573  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.76 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.36 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  47.24 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  47.24 
 
 		 204 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.22 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  42.86 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0469  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  45.39 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  41.1 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  44.37 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.66 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.74 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  44.93 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.51 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1908  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.45 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.17 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.45 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.6 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.6 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.62 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  45.8 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  43.75 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  41.67 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  42.47 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  47.24 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  41.96 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  43.75 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.26 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.11 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  43.15 
 
 		 152 aa  103  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  44.53 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  38.36 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  41.26 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4585  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.28 
 
 		 178 aa  103  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639578 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  38.36 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.27 
 
 		 190 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  44.53 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.52 
 
 		 177 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0476  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.25 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.13 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  43.06 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.19 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  42.36 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.31 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  41.67 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  42.36 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  43.06 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  43.75 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  43.06 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.75 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.72 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.36 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  43.06 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  43.06 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  43.06 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  42.36 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.73 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  40.13 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  39.87 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.87 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.14 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  39.87 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  39.87 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.14 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  42.36 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  42.36 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  42.36 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  42.36 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  42.45 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  40.13 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.1 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.14 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.18 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  42.47 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  42.47 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  40.14 
 
 		 222 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.72 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>