More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3095 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.53 
 
 
173 aa  225  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  69.86 
 
 
157 aa  223  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  69.86 
 
 
204 aa  221  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.13 
 
 
149 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0476  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.31 
 
 
145 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  66.67 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.03 
 
 
164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.28 
 
 
148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  63.7 
 
 
148 aa  197  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  60.54 
 
 
148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.9 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  64.34 
 
 
149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.01 
 
 
148 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.19 
 
 
148 aa  191  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.22 
 
 
146 aa  189  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.97 
 
 
142 aa  188  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.44 
 
 
148 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.44 
 
 
171 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.75 
 
 
158 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  62.68 
 
 
151 aa  187  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.08 
 
 
155 aa  187  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.53 
 
 
147 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.53 
 
 
147 aa  186  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.19 
 
 
158 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.53 
 
 
147 aa  185  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.89 
 
 
148 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.66 
 
 
162 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  66.41 
 
 
150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.64 
 
 
149 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1908  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.38 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.64 
 
 
146 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.14 
 
 
151 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1926  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.67 
 
 
144 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512826  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  50 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0469  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  48.59 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0941  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.9 
 
 
150 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180946  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2267  hypothetical protein  66.96 
 
 
150 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0504375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  55.81 
 
 
159 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0573  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.29 
 
 
139 aa  141  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  47.55 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.75 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  51.75 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2230  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.37 
 
 
114 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000174043  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56 
 
 
178 aa  136  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  54.33 
 
 
174 aa  136  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
231 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  44.22 
 
 
156 aa  133  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.55 
 
 
168 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.55 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2789  hypothetical protein  64.58 
 
 
151 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.769709  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  46.85 
 
 
148 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  46.85 
 
 
148 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.36 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.07 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.61 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  44.06 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.86 
 
 
484 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.76 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  47.55 
 
 
187 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  43.84 
 
 
183 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  47.55 
 
 
200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  43.17 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.85 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.76 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.47 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  47.55 
 
 
200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  44.76 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.39 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.47 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.22 
 
 
164 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.3 
 
 
150 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  43.75 
 
 
155 aa  124  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  44.06 
 
 
177 aa  123  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
411 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.36 
 
 
166 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  45.83 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  45.93 
 
 
137 aa  123  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 
158 aa  123  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
148 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.18 
 
 
363 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.5 
 
 
148 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
169 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.25 
 
 
168 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.66 
 
 
156 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.66 
 
 
156 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  46.48 
 
 
205 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  45.45 
 
 
168 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.06 
 
 
168 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
461 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
154 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
154 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.76 
 
 
155 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.21 
 
 
187 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.76 
 
 
151 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.58 
 
 
144 aa  120  9e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
193 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>