More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1618 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  100 
 
 		 158 aa  332  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.05 
 
 		 176 aa  207  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.99 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  63.95 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  60.67 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 		 200 aa  188  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.67 
 
 		 178 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.33 
 
 		 175 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 		 200 aa  187  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.67 
 
 		 175 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.33 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.67 
 
 		 174 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.33 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  59.33 
 
 		 182 aa  184  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  62.59 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.22 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.84 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  56.41 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.31 
 
 		 189 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  60.67 
 
 		 169 aa  180  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.93 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  60.67 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  60.67 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  57.82 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  60 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.49 
 
 		 177 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.67 
 
 		 252 aa  176  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  58.5 
 
 		 178 aa  176  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  58 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  58 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.71 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  58 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  58 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  58 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  58 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  59.71 
 
 		 182 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  57.33 
 
 		 167 aa  174  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  59.33 
 
 		 222 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.1 
 
 		 223 aa  174  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  57.14 
 
 		 166 aa  173  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.48 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  56.64 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.96 
 
 		 194 aa  167  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  61.31 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  54.42 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.56 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.79 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  55.78 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  51.35 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.35 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.67 
 
 		 231 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.05 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  53.1 
 
 		 165 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.75 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  53.74 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.74 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  52.52 
 
 		 177 aa  154  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.73 
 
 		 461 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.05 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.01 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.7 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  51.7 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.17 
 
 		 475 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.02 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.02 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.1 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  50.34 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  51.05 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  54.96 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  52.67 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  49.32 
 
 		 172 aa  150  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.67 
 
 		 176 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.43 
 
 		 484 aa  150  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  52.67 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  51.75 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.28 
 
 		 165 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  54.76 
 
 		 196 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  45.95 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  49.32 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  53.15 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.34 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  50.35 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.95 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  58.33 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  52.45 
 
 		 149 aa  147  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.64 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.65 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>