More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1349 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  97.8 
 
 		 182 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  70.62 
 
 		 165 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.15 
 
 		 159 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  72.37 
 
 		 158 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  70.55 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.74 
 
 		 158 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  70.78 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1076  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.07 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0297502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1032  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.51 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.22 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1035  cumB protein  71.03 
 
 		 145 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.85 
 
 		 152 aa  184  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.48 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.59 
 
 		 154 aa  180  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  60.14 
 
 		 151 aa  180  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  59.18 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.9 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.45 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  56.58 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  58.22 
 
 		 146 aa  174  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.86 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.25 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.25 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.43 
 
 		 361 aa  171  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.78 
 
 		 484 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.43 
 
 		 361 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  53.55 
 
 		 165 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  61.48 
 
 		 137 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  55.19 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  54.42 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  52.2 
 
 		 168 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  51.95 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.95 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.55 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.81 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  60.84 
 
 		 196 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  53.74 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  60.14 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.33 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1285  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.09 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2538  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.09 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3297  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.09 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2013  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.09 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.53 
 
 		 461 aa  160  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.53 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2394  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.09 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.69 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2437  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.09 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  55.7 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  50.65 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.1 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.7 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.32 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.65 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.07 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  62.3 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  53.42 
 
 		 152 aa  158  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.3 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.3 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  50.65 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.3 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  53.95 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  54.97 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.88 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  50 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.69 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  50.65 
 
 		 200 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2062  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.74 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.9 
 
 		 190 aa  157  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.65 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.39 
 
 		 176 aa  157  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1514  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.26 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.43 
 
 		 231 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.61 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.68 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  54.3 
 
 		 195 aa  157  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  51.66 
 
 		 169 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.66 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  54.55 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  59.54 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  50.67 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.9 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.17 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  47.74 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  48.03 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.9 
 
 		 411 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.64 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  52.94 
 
 		 171 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.04 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.33 
 
 		 482 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.72 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>