More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1603 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0169  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70 
 
 
175 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000421684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.2 
 
 
190 aa  168  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.09 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1779  tRNA-adenosine deaminase  56.25 
 
 
172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.073182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.67 
 
 
195 aa  157  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.53 
 
 
159 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  56.85 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
152 aa  150  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  57.64 
 
 
165 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.11 
 
 
158 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  53.85 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.85 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  55.24 
 
 
176 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  53.16 
 
 
189 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.22 
 
 
169 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  60.16 
 
 
169 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  53.21 
 
 
158 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.17 
 
 
168 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  53.68 
 
 
137 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  53.79 
 
 
183 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  46.26 
 
 
160 aa  140  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
148 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  48.1 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  51.35 
 
 
148 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  48.41 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  48.1 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  52.05 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  54.55 
 
 
151 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.7 
 
 
157 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  56.69 
 
 
182 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  53.15 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.72 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.45 
 
 
182 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.45 
 
 
182 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.63 
 
 
363 aa  137  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.15 
 
 
156 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  56.69 
 
 
182 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
146 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.34 
 
 
223 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 
154 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
144 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1032  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.63 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136233  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.2 
 
 
159 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  58.4 
 
 
196 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
187 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
146 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1035  cumB protein  59.84 
 
 
145 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.97 
 
 
176 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1076  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.84 
 
 
159 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0297502  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  49.31 
 
 
158 aa  134  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.62 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  58.54 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.54 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
172 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.54 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.54 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.67 
 
 
231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.89 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.54 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.34 
 
 
167 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  53.42 
 
 
171 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  45.34 
 
 
167 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.08 
 
 
146 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  44.72 
 
 
167 aa  131  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  44.72 
 
 
178 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  44.72 
 
 
178 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 
175 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  44.72 
 
 
178 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  44.72 
 
 
178 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  44.72 
 
 
178 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
411 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.15 
 
 
484 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.57 
 
 
175 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  44.72 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.67 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.7 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  47.3 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.75 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.92 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.91 
 
 
179 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.16 
 
 
166 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  46.85 
 
 
147 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
159 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  46.94 
 
 
153 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  49.65 
 
 
150 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 
174 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  47.26 
 
 
169 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.81 
 
 
168 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.67 
 
 
461 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
162 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>