More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01142 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  91.72 
 
 
182 aa  295  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  79.88 
 
 
193 aa  275  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  61.59 
 
 
177 aa  206  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  66.23 
 
 
222 aa  204  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.58 
 
 
175 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.09 
 
 
178 aa  200  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.94 
 
 
175 aa  199  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.94 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.94 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.94 
 
 
174 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.67 
 
 
177 aa  196  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  64.58 
 
 
189 aa  195  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.78 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  58.82 
 
 
165 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.58 
 
 
252 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  66.23 
 
 
222 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  57.05 
 
 
200 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.66 
 
 
170 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.42 
 
 
176 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  57.05 
 
 
200 aa  185  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.62 
 
 
177 aa  184  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  55.7 
 
 
187 aa  183  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.87 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  54.49 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  56.86 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  56.41 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  56.49 
 
 
172 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 
164 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  56.49 
 
 
172 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  56.49 
 
 
172 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
167 aa  181  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.33 
 
 
162 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.85 
 
 
167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  53.85 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  56.49 
 
 
172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  56.49 
 
 
172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.56 
 
 
168 aa  179  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.9 
 
 
190 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  64.23 
 
 
194 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.45 
 
 
152 aa  176  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  58.7 
 
 
182 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  56.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  55.03 
 
 
169 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.85 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.93 
 
 
155 aa  167  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  56.25 
 
 
146 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 
152 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.55 
 
 
484 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  50.31 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.32 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.32 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  58.82 
 
 
137 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.34 
 
 
154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  51.01 
 
 
168 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.17 
 
 
461 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.33 
 
 
163 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  51.01 
 
 
183 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.47 
 
 
181 aa  155  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.05 
 
 
166 aa  152  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.78 
 
 
231 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  54.23 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.4 
 
 
361 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.4 
 
 
361 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.32 
 
 
166 aa  150  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
148 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
148 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2538  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  53.52 
 
 
165 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2394  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2013  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.52 
 
 
154 aa  149  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1285  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2437  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.33 
 
 
475 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.15 
 
 
156 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3297  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
198 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1514  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.43 
 
 
162 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  52.17 
 
 
189 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50.32 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.11 
 
 
159 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  56.45 
 
 
196 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  59.69 
 
 
164 aa  148  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  49.68 
 
 
166 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  46.67 
 
 
160 aa  148  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.1 
 
 
174 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.68 
 
 
168 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.11 
 
 
148 aa  147  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  49.68 
 
 
166 aa  147  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.1 
 
 
164 aa  147  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>