More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3417 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  80.38 
 
 		 158 aa  250  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  77.42 
 
 		 159 aa  247  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  76.97 
 
 		 165 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  70.7 
 
 		 169 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  71.34 
 
 		 169 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1076  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  76.77 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0297502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1032  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  75.48 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  67.74 
 
 		 182 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  67.74 
 
 		 182 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1035  cumB protein  77.78 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.9 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.59 
 
 		 152 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.54 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.53 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  59.86 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  58.5 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  54.73 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.14 
 
 		 197 aa  168  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1476  tRNA-adenosine deaminase  57.53 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.76 
 
 		 484 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.42 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  52.7 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.42 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  56.38 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.38 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.08 
 
 		 361 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.41 
 
 		 361 aa  163  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.11 
 
 		 193 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  52.6 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.81 
 
 		 187 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.08 
 
 		 190 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  54.42 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  60.84 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  56.3 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 		 168 aa  160  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  52.74 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  52.74 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.06 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  56.34 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.87 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  51.72 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.03 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  57.14 
 
 		 205 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.72 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  51.72 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.69 
 
 		 174 aa  156  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  51.72 
 
 		 178 aa  156  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  51.72 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  51.72 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  51.72 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  51.72 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  48.68 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.16 
 
 		 411 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  52.23 
 
 		 168 aa  154  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.35 
 
 		 223 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.74 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  60.87 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.87 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  51.75 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.87 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.87 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.02 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.75 
 
 		 167 aa  153  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  49.34 
 
 		 222 aa  153  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.1 
 
 		 175 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.98 
 
 		 231 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.32 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.01 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  50.68 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.34 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.02 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.04 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2538  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.5 
 
 		 198 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2013  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.5 
 
 		 198 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3297  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.5 
 
 		 198 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62763  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1285  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.5 
 
 		 198 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2394  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.5 
 
 		 198 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2437  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.5 
 
 		 198 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.64 
 
 		 475 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  51.02 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.02 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.11 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.79 
 
 		 461 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.32 
 
 		 252 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.66 
 
 		 194 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2062  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  57.82 
 
 		 194 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>