More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01393 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.96 
 
 
175 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  54.14 
 
 
222 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  58.75 
 
 
200 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  58.62 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  58.62 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  58.62 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  58.62 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  58.75 
 
 
200 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  58.75 
 
 
187 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  61.63 
 
 
172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  61.63 
 
 
172 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  58.62 
 
 
178 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.46 
 
 
167 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  63.46 
 
 
167 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  61.05 
 
 
172 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  61.05 
 
 
172 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  62.82 
 
 
167 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.99 
 
 
175 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.41 
 
 
174 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.94 
 
 
175 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  60.47 
 
 
172 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  62.82 
 
 
167 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.86 
 
 
164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.39 
 
 
170 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.35 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.18 
 
 
164 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.75 
 
 
162 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  55.25 
 
 
222 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.54 
 
 
177 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  59.01 
 
 
169 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  58.44 
 
 
165 aa  204  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.33 
 
 
194 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  58.44 
 
 
168 aa  201  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.52 
 
 
169 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.55 
 
 
176 aa  201  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.21 
 
 
168 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  58.44 
 
 
155 aa  194  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.22 
 
 
189 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.94 
 
 
177 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  59.35 
 
 
166 aa  191  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.27 
 
 
178 aa  191  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  54.14 
 
 
182 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.09 
 
 
190 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  53.85 
 
 
164 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.25 
 
 
182 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.85 
 
 
182 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.97 
 
 
163 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  50.31 
 
 
193 aa  177  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  56 
 
 
183 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  51.83 
 
 
177 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  52.67 
 
 
158 aa  175  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  54.09 
 
 
177 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  56.62 
 
 
137 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  59.74 
 
 
162 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  53.19 
 
 
182 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.33 
 
 
475 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  54.67 
 
 
168 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.86 
 
 
361 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.86 
 
 
361 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  52.78 
 
 
146 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
148 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 
148 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.86 
 
 
484 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.55 
 
 
154 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.69 
 
 
152 aa  168  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  56.25 
 
 
163 aa  168  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.59 
 
 
231 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  55.24 
 
 
165 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.93 
 
 
166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.93 
 
 
166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.93 
 
 
166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
166 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  50.93 
 
 
166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.93 
 
 
166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.03 
 
 
175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.65 
 
 
152 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.25 
 
 
162 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 
166 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
166 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.96 
 
 
167 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  51.95 
 
 
158 aa  161  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.15 
 
 
159 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  54.86 
 
 
149 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.7 
 
 
160 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.86 
 
 
151 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  54.62 
 
 
151 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  50.35 
 
 
152 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  55.47 
 
 
182 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  49.07 
 
 
166 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.31 
 
 
174 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  52.38 
 
 
170 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  54.36 
 
 
196 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  51.92 
 
 
177 aa  158  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.38 
 
 
461 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.92 
 
 
177 aa  158  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  55.84 
 
 
169 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  54.74 
 
 
182 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  54.17 
 
 
149 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.66 
 
 
156 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>