More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3629 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
166 aa  343  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  91.57 
 
 
166 aa  319  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  70.7 
 
 
176 aa  239  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  68.75 
 
 
171 aa  238  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  70.25 
 
 
179 aa  223  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.16 
 
 
157 aa  222  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  70.42 
 
 
181 aa  210  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.32 
 
 
160 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.89 
 
 
165 aa  191  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  60.76 
 
 
159 aa  190  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  54.22 
 
 
166 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  54.22 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.22 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  54.22 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  54.22 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.22 
 
 
166 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  53.61 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.84 
 
 
156 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.84 
 
 
156 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  55.35 
 
 
166 aa  184  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  54.72 
 
 
166 aa  184  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.13 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.56 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.75 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54 
 
 
166 aa  171  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.66 
 
 
161 aa  167  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.06 
 
 
151 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.94 
 
 
164 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  55.4 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.7 
 
 
167 aa  163  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.45 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.42 
 
 
154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  52.03 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  52.23 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  51.32 
 
 
161 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.7 
 
 
155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.38 
 
 
175 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
160 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.72 
 
 
162 aa  160  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
175 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
175 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  53.42 
 
 
176 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.52 
 
 
152 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  51.32 
 
 
172 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  50.64 
 
 
160 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  49.67 
 
 
158 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.75 
 
 
183 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 
150 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.72 
 
 
182 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.62 
 
 
154 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.72 
 
 
182 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.81 
 
 
176 aa  157  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  50.34 
 
 
151 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
144 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  49.65 
 
 
150 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  54.23 
 
 
189 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.72 
 
 
158 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  49.67 
 
 
177 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  48.1 
 
 
222 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12760  tRNA-adenosine deaminase  48.05 
 
 
206 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255164  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  50.64 
 
 
168 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  51.37 
 
 
146 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.86 
 
 
158 aa  154  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.66 
 
 
166 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  49.68 
 
 
158 aa  152  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.41 
 
 
152 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.2 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  46.79 
 
 
183 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
177 aa  151  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.17 
 
 
164 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
148 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.39 
 
 
166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.72 
 
 
168 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
154 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  55.4 
 
 
143 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.74 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
154 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.12 
 
 
177 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.02 
 
 
178 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  45.89 
 
 
148 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  45.89 
 
 
148 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.54 
 
 
181 aa  148  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.35 
 
 
176 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.55 
 
 
154 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.9 
 
 
168 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.31 
 
 
156 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.32 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.09 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.81 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  48.65 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.35 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.72 
 
 
157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.64 
 
 
194 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.65 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 
361 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.35 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>