More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2230 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2230  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
114 aa  227  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000174043  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0941  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  95.54 
 
 
150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180946  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2267  hypothetical protein  94.64 
 
 
150 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0504375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1218  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.57 
 
 
142 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.45 
 
 
164 aa  163  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.34 
 
 
147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.45 
 
 
147 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  69.91 
 
 
171 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.57 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.68 
 
 
149 aa  160  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.8 
 
 
158 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.91 
 
 
158 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.37 
 
 
147 aa  153  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.91 
 
 
149 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0911  cytidine and deoxycytidylate deaminase  69.91 
 
 
149 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.312122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.54 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.26 
 
 
148 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0476  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.6 
 
 
145 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0521  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.49 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  76.99 
 
 
162 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  68.14 
 
 
148 aa  147  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1926  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75.22 
 
 
144 aa  147  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512826  normal  0.748539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.49 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.49 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.49 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.72 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1908  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.91 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.95 
 
 
173 aa  143  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  62.83 
 
 
148 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  65.49 
 
 
151 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.37 
 
 
148 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  61.06 
 
 
204 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  61.06 
 
 
157 aa  140  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2323  tRNA-adenosine deaminase  69.61 
 
 
150 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.034799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1211  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding protein  55.75 
 
 
148 aa  133  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0208856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2789  hypothetical protein  76.99 
 
 
151 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.769709  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.41 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  60.18 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.29 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  57.52 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.77 
 
 
178 aa  123  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0469  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  57.84 
 
 
135 aa  117  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0449  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  52.21 
 
 
140 aa  117  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0573  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.9 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  53.98 
 
 
150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.75 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  52.1 
 
 
168 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.04 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  47.71 
 
 
170 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  49.12 
 
 
152 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  48.11 
 
 
160 aa  104  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.9 
 
 
154 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  47.79 
 
 
161 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  49.56 
 
 
144 aa  103  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  42.48 
 
 
158 aa  103  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.5 
 
 
168 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.67 
 
 
152 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.48 
 
 
154 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.44 
 
 
154 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.15 
 
 
152 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.02 
 
 
148 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
166 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.28 
 
 
154 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.46 
 
 
193 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.46 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  50.44 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5283  tRNA-adenosine deaminase  50.46 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  46.9 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6109  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.46 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1968  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.46 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.67 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1883  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.46 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839631  normal  0.641763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
187 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  51.96 
 
 
146 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
475 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.35 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  49.54 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  52.48 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  49.56 
 
 
182 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.13 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.13 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.67 
 
 
168 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.02 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  44.44 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.05 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.07 
 
 
190 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.6 
 
 
165 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.72 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.98 
 
 
195 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.4 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.94 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  53.92 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.48 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  43.36 
 
 
177 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.59 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.9 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  49.54 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>