More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0204 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  100 
 
 
168 aa  345  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  75.32 
 
 
156 aa  253  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  75.32 
 
 
156 aa  253  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.4 
 
 
160 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.78 
 
 
165 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  59.75 
 
 
166 aa  198  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.96 
 
 
164 aa  198  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.75 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  59.75 
 
 
166 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  59.75 
 
 
166 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.75 
 
 
166 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  59.75 
 
 
166 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  59.12 
 
 
166 aa  197  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  59.12 
 
 
166 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  59.12 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.38 
 
 
164 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.2 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.14 
 
 
148 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.29 
 
 
166 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.23 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  51.97 
 
 
159 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56 
 
 
166 aa  176  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.01 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.7 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.87 
 
 
176 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
181 aa  170  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  50.33 
 
 
161 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.42 
 
 
151 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  51.97 
 
 
170 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  47.44 
 
 
177 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  49.04 
 
 
171 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  57.33 
 
 
168 aa  166  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  49.01 
 
 
172 aa  166  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.52 
 
 
167 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.69 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  55.41 
 
 
150 aa  163  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.02 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  52.48 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.32 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  51.33 
 
 
159 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  48.08 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.77 
 
 
183 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.9 
 
 
154 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.67 
 
 
166 aa  159  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  51.7 
 
 
158 aa  159  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  49.67 
 
 
222 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.63 
 
 
179 aa  158  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  47.92 
 
 
189 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  53.79 
 
 
155 aa  157  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.47 
 
 
175 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.65 
 
 
150 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.8 
 
 
174 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48 
 
 
168 aa  155  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.33 
 
 
164 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.44 
 
 
175 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.37 
 
 
175 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.83 
 
 
231 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.63 
 
 
148 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  45.51 
 
 
165 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.1 
 
 
177 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  47.71 
 
 
172 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  48.98 
 
 
156 aa  152  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.02 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  47.3 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  47.55 
 
 
144 aa  151  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.65 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.64 
 
 
154 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12760  tRNA-adenosine deaminase  48.39 
 
 
206 aa  150  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255164  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  50.33 
 
 
222 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.58 
 
 
152 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.36 
 
 
177 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.67 
 
 
252 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.72 
 
 
161 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.97 
 
 
152 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.95 
 
 
168 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  49.32 
 
 
146 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  44.87 
 
 
168 aa  148  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.94 
 
 
461 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
189 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
178 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  48.68 
 
 
164 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.68 
 
 
181 aa  147  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
178 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  47.2 
 
 
178 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
178 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.2 
 
 
167 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
167 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
182 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
182 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  52.11 
 
 
151 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
178 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  47.2 
 
 
167 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.98 
 
 
158 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4585  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.37 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.639578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.06 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.06 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  45.33 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.16 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>