More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0327 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.15 
 
 
166 aa  207  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.64 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  62 
 
 
171 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.06 
 
 
176 aa  188  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  64.96 
 
 
179 aa  187  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  56.38 
 
 
161 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.76 
 
 
181 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.78 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.78 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.27 
 
 
151 aa  176  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.74 
 
 
157 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.08 
 
 
150 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.42 
 
 
160 aa  173  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.33 
 
 
168 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 
162 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.75 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  55.63 
 
 
159 aa  170  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.42 
 
 
165 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  55.8 
 
 
170 aa  165  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  49.34 
 
 
172 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.32 
 
 
176 aa  164  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.96 
 
 
182 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.96 
 
 
182 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  50 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.67 
 
 
164 aa  161  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  56.52 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.99 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.33 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  49.33 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.82 
 
 
190 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  50.34 
 
 
158 aa  160  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.52 
 
 
154 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.68 
 
 
177 aa  160  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.32 
 
 
168 aa  159  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.13 
 
 
166 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.67 
 
 
174 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  55.03 
 
 
168 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.8 
 
 
183 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  47.13 
 
 
166 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  47.13 
 
 
166 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.13 
 
 
166 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.67 
 
 
175 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  47.13 
 
 
166 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.33 
 
 
163 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  48.67 
 
 
166 aa  158  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.67 
 
 
175 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  47.13 
 
 
166 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.86 
 
 
158 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  47.13 
 
 
166 aa  157  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.67 
 
 
175 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.06 
 
 
166 aa  157  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.61 
 
 
158 aa  157  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.34 
 
 
164 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.68 
 
 
178 aa  155  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  55.4 
 
 
144 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.94 
 
 
176 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  54.73 
 
 
146 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
152 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.7 
 
 
153 aa  154  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  49.33 
 
 
222 aa  154  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  49.66 
 
 
183 aa  152  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.49 
 
 
194 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
200 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 
160 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
164 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  54.48 
 
 
167 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  52.82 
 
 
148 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.37 
 
 
166 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  52.82 
 
 
148 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.74 
 
 
252 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
200 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  49.01 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.3 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.97 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.07 
 
 
154 aa  151  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
187 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  50.74 
 
 
222 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  50.7 
 
 
151 aa  151  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  49.66 
 
 
168 aa  151  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.61 
 
 
223 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.38 
 
 
475 aa  150  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.23 
 
 
155 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.67 
 
 
177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  49.03 
 
 
169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  52 
 
 
158 aa  150  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  48.97 
 
 
156 aa  150  7e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
137 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.68 
 
 
361 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.68 
 
 
361 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.89 
 
 
148 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  50.32 
 
 
167 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  50.32 
 
 
178 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.32 
 
 
167 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.37 
 
 
154 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  50.32 
 
 
167 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  50.32 
 
 
178 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  50.32 
 
 
178 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  50.32 
 
 
178 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>