More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3779 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
154 aa  300  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  98.7 
 
 
160 aa  298  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  98.7 
 
 
183 aa  295  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  85.81 
 
 
150 aa  252  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.45 
 
 
151 aa  167  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.56 
 
 
166 aa  167  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  62.5 
 
 
144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.67 
 
 
168 aa  164  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 
166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  53.79 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.74 
 
 
166 aa  159  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.62 
 
 
166 aa  157  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  55.41 
 
 
163 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
157 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  57.04 
 
 
146 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  57.25 
 
 
171 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  58.27 
 
 
179 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.52 
 
 
176 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  54.93 
 
 
166 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
156 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  54.93 
 
 
148 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  54.93 
 
 
148 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  56.34 
 
 
155 aa  154  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.28 
 
 
165 aa  154  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 
156 aa  154  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.05 
 
 
156 aa  154  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  64.12 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  54.23 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  53.52 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  51.68 
 
 
172 aa  153  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12760  tRNA-adenosine deaminase  54.67 
 
 
206 aa  153  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255164  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.41 
 
 
152 aa  153  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.7 
 
 
160 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.94 
 
 
154 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  56.34 
 
 
159 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.14 
 
 
168 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  52.82 
 
 
166 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.52 
 
 
166 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.07 
 
 
164 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  53.52 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.52 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  53.52 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  53.52 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.28 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  49.28 
 
 
170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.41 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.64 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  57.04 
 
 
168 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.99 
 
 
181 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  58.5 
 
 
176 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
162 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.65 
 
 
167 aa  149  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.19 
 
 
152 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  57.34 
 
 
158 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.23 
 
 
154 aa  148  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
182 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.1 
 
 
161 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.23 
 
 
182 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.82 
 
 
168 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  51.41 
 
 
159 aa  147  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.24 
 
 
158 aa  147  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.59 
 
 
151 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
152 aa  147  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  59.44 
 
 
143 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.14 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.57 
 
 
484 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  51.41 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 
160 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.11 
 
 
164 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  47.89 
 
 
172 aa  144  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.79 
 
 
159 aa  144  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  52.41 
 
 
168 aa  143  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.81 
 
 
190 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  53.47 
 
 
183 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.81 
 
 
461 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  44.37 
 
 
158 aa  142  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.63 
 
 
142 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  52.82 
 
 
165 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  51.41 
 
 
150 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  51.41 
 
 
168 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.52 
 
 
177 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.55 
 
 
158 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.07 
 
 
168 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.97 
 
 
185 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.3 
 
 
148 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  46.98 
 
 
195 aa  140  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  47.18 
 
 
161 aa  140  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4585  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.34 
 
 
178 aa  140  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.639578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.59 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
363 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.11 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  48.59 
 
 
178 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.7 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.4 
 
 
361 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.3 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  55.48 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.68 
 
 
361 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.34 
 
 
153 aa  138  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.31 
 
 
197 aa  138  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>