More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3135 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  97.39 
 
 
153 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  96.05 
 
 
153 aa  276  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.92 
 
 
152 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  56.67 
 
 
156 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  55.03 
 
 
151 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  52.38 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.96 
 
 
163 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.33 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.03 
 
 
156 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  40.26 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  37.58 
 
 
153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.54 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.31 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.85 
 
 
147 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.26 
 
 
155 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.26 
 
 
157 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.28 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.62 
 
 
183 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.75 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.75 
 
 
163 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.69 
 
 
155 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.67 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.69 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36 
 
 
154 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.46 
 
 
158 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  33.99 
 
 
159 aa  104  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.99 
 
 
159 aa  104  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  33.12 
 
 
155 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.67 
 
 
158 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.87 
 
 
157 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  34.44 
 
 
149 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
223 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.05 
 
 
155 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.66 
 
 
160 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.66 
 
 
160 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  33.55 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.45 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  36.17 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.26 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.59 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.78 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.49 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.44 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.59 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  30.94 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.48 
 
 
164 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.38 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  44.25 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.52 
 
 
188 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.54 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  35.81 
 
 
186 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.5 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.44 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  34.72 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  39.81 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.22 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.06 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  47.25 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.6 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  30.77 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  47.78 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.68 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  34.87 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  45.74 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.16 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.67 
 
 
484 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  42.42 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.1 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.21 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.1 
 
 
214 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.82 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.16 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.58 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  41.49 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.42 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.37 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.83 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.39 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.37 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  34.75 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.05 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  43.16 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.56 
 
 
461 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.83 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.5 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  42.22 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.71 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.35 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.01 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.16 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.37 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  31.29 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>