More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3292 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.62 
 
 
188 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.44 
 
 
158 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.53 
 
 
150 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.3 
 
 
183 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.22 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.7 
 
 
163 aa  130  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  35.68 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.83 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  35.83 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  34.97 
 
 
157 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.98 
 
 
155 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  34.78 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.52 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.87 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.85 
 
 
157 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.97 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.92 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  37.72 
 
 
153 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.17 
 
 
155 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.92 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.26 
 
 
157 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  42.21 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.86 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  34.07 
 
 
161 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
161 aa  101  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  38.41 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  35.36 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.15 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  36.02 
 
 
148 aa  98.2  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.84 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.74 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  32.4 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  31.87 
 
 
151 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.57 
 
 
223 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  30.46 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.57 
 
 
158 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.57 
 
 
163 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.52 
 
 
152 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.91 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.88 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  36.67 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  31.15 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.22 
 
 
156 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.94 
 
 
153 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.83 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  32.43 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.28 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  30.81 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  28.26 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.76 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.92 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.08 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
301 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.11 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.27 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  36.57 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  32.02 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  30.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  30.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.36 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.64 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  37.21 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.09 
 
 
166 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.07 
 
 
158 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.61 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.71 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.81 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.59 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.86 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.35 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  31.34 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.25 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  32.35 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  32.06 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.61 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  33.08 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.15 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.35 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29.93 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.33 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  35.38 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  32.82 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.15 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.78 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.38 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.38 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  31.82 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.44 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.61 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.58 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.41 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.48 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>