More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1831 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  100 
 
 
149 aa  310  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  52.98 
 
 
154 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.33 
 
 
159 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 
160 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  47.37 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.37 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.67 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.03 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.02 
 
 
158 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.74 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  44.74 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.94 
 
 
155 aa  135  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  45.03 
 
 
163 aa  133  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  57.52 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.47 
 
 
158 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  49.17 
 
 
153 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.1 
 
 
155 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
159 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.23 
 
 
155 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.74 
 
 
157 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.04 
 
 
164 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.76 
 
 
164 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  40.14 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.21 
 
 
160 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.74 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.96 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.41 
 
 
160 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  42.21 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  36.84 
 
 
186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.37 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.06 
 
 
163 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  40.71 
 
 
164 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  35.1 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  34.44 
 
 
151 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  39.61 
 
 
158 aa  104  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.07 
 
 
141 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.61 
 
 
223 aa  103  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 
190 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.24 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.26 
 
 
157 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.5 
 
 
147 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  37.58 
 
 
182 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  35.33 
 
 
161 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 
156 aa  95.9  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.38 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.28 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.14 
 
 
211 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  47.96 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.11 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.61 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  36.69 
 
 
176 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.98 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.72 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.54 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  46.15 
 
 
204 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.77 
 
 
153 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.18 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.48 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  46.15 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50 
 
 
143 aa  93.2  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.71 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.13 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.64 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  39.13 
 
 
159 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  38.93 
 
 
193 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.25 
 
 
214 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.42 
 
 
147 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.06 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.96 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.42 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.08 
 
 
173 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.41 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  42.2 
 
 
161 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.78 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  42.42 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.67 
 
 
161 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.97 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  39.34 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  37.25 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  44 
 
 
177 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.73 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  45.1 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.61 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.96 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  35.21 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.9 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  47.13 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.53 
 
 
461 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  31.13 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.08 
 
 
148 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.33 
 
 
144 aa  87  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.5 
 
 
301 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  35.33 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.42 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>