More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3456 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  97.39 
 
 
153 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  94.74 
 
 
153 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.92 
 
 
152 aa  201  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  54.67 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  53.69 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  51.02 
 
 
151 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.32 
 
 
163 aa  154  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.01 
 
 
157 aa  151  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.05 
 
 
156 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  38.96 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  36.91 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.69 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.97 
 
 
158 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.85 
 
 
147 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.26 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.55 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.94 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.95 
 
 
183 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.75 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.76 
 
 
160 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.31 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.62 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.51 
 
 
158 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  34.67 
 
 
154 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.97 
 
 
153 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.56 
 
 
157 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  33.77 
 
 
149 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.03 
 
 
159 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  32.47 
 
 
155 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.67 
 
 
158 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.67 
 
 
223 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.69 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
160 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  33.55 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.18 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  32.03 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  32.03 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.46 
 
 
158 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  34.75 
 
 
163 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.61 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.88 
 
 
161 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.78 
 
 
159 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.77 
 
 
164 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.61 
 
 
158 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.49 
 
 
190 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.56 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  43.36 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.98 
 
 
188 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  29.28 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.84 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.25 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  35.14 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  34.87 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.95 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  34.03 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.11 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  37.96 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.56 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  45.05 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  31.01 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  45.74 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.67 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.34 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  46.75 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.05 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.79 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  39 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  34.35 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.11 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.41 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.05 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.37 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.77 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.22 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.21 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  37.89 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  36.24 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  39.36 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  33.05 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  47.5 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.16 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.37 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  41.11 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  41.05 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.41 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.75 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.05 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183859  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.53 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.32 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.49 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.94 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>