More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2805 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
158 aa  333  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.06 
 
 
158 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.48 
 
 
183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.21 
 
 
160 aa  189  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.97 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  54.43 
 
 
157 aa  186  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  56.13 
 
 
163 aa  184  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.86 
 
 
155 aa  183  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  48.72 
 
 
159 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.72 
 
 
159 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.3 
 
 
150 aa  177  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.59 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.48 
 
 
159 aa  170  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.64 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  50 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  45.03 
 
 
154 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.1 
 
 
161 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46 
 
 
190 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.22 
 
 
164 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.88 
 
 
160 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.25 
 
 
160 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.68 
 
 
155 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.99 
 
 
155 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
164 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  48 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 
161 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.68 
 
 
158 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.94 
 
 
214 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  44.83 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  42.77 
 
 
176 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.14 
 
 
159 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.4 
 
 
211 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.18 
 
 
223 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.86 
 
 
155 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  47.44 
 
 
186 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  43.36 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  43.05 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  39.47 
 
 
149 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  40 
 
 
151 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  47.33 
 
 
158 aa  123  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  39.58 
 
 
151 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  35.52 
 
 
188 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  48.7 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.85 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.22 
 
 
188 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.96 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.11 
 
 
163 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
165 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.87 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  49.54 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  38.51 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  43.92 
 
 
158 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  39.04 
 
 
154 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  39.04 
 
 
154 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.48 
 
 
181 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.79 
 
 
158 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  37.66 
 
 
168 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.64 
 
 
161 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.89 
 
 
158 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.16 
 
 
154 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  51.55 
 
 
146 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.93 
 
 
158 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.19 
 
 
169 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.37 
 
 
190 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.83 
 
 
163 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  38.28 
 
 
148 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  38.28 
 
 
148 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.56 
 
 
153 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
151 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
159 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 
190 aa  101  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.75 
 
 
484 aa  101  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.37 
 
 
161 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.73 
 
 
156 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.16 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  35.77 
 
 
171 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.63 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.86 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.07 
 
 
301 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  40 
 
 
182 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.43 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.51 
 
 
475 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.16 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  36.91 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  43.61 
 
 
151 aa  97.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  35.14 
 
 
170 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.8 
 
 
193 aa  97.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  42.2 
 
 
182 aa  97.1  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.16 
 
 
156 aa  97.1  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.16 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.33 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.82 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  44.55 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  38.46 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 
204 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.81 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.56 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>